苏格兰松针叶微生物组—转录组数据集上线，覆盖 200 个基因型与病程关键节点

学术圈重大事件 · 发布 2026-08-20T21:40:00+08:00 · 更新 2026-08-20T21:42:41+08:00

核心结论

Scientific Data 8 月 20 日发布苏格兰松红带针叶病多组学数据：苏格兰南部子代—种源田间试验覆盖不同易感性的 200 个基因型，在三个时间点采集 ITS2 真菌宏条形码；另对 48 个基因型在两个时间点开展 RNA-seq。采样覆盖病原暴露和发病进展，并设置阴阳性质量控制。数据已存入欧洲核苷酸档案 PRJEB88228，可用于宿主基因型、叶际真菌群落和疾病动态研究，但本身不是因果结论。

数据发布。 Scientific Data 8 月 20 日发布一套苏格兰松（Pinus sylvestris）针叶微生物组和宿主转录组数据。红带针叶病由 Dothistroma septosporum 引起，是全球重要的针叶病害；宿主基因型、叶际真菌群落与病程如何相互作用，关系到森林育种和气候变化下的病害韧性。数据来自苏格兰南部一个子代—种源田间试验，样本覆盖从较耐受到较易感的广泛病害表型。

数据规模。 ITS2 真菌宏条形码部分覆盖 200 个基因型、三个时间点；RNA-seq 部分覆盖 48 个基因型、两个时间点。时间安排横跨病原暴露和疾病进展的关键阶段，使研究者能够比较叶际真菌群落的时间变化、宿主—微生物转录响应，以及基因型依赖的易感性差异。作者同时使用标准与定制的核酸提取、测序和质控流程，并加入多组阴性和阳性对照，便于识别试剂污染、批次效应和扩增偏差。

为什么重要。 森林病害研究常有宏条形码或转录组单一数据，却缺少在同一田间试验中、跨基因型和病程节点对齐的材料。该数据集允许把“有哪些真菌”与“宿主和微生物在表达什么”结合起来，构建共现网络、病程预测或候选抗性标记。原始和组装数据存入欧洲核苷酸档案，项目号 PRJEB88228，也为独立团队复算流程、测试新的去噪和多组学整合方法提供公共基准。

还需观察。 数据来自单一地区和田间试验，群落结构会受气候、林分管理、树龄和测序批次影响；ITS2 相对丰度不能直接等同于活性或生物量。200 与 48 个基因型的两类数据规模不同，多组学联合分析需处理缺失和抽样偏差。数据集提出宿主基因型影响微生物和病害的假设，但不能单独证明因果，仍需接种、共同花园和跨地区复现。

信息来源

• Scientific Data 数据论文页面
• European Nucleotide Archive 项目页面

可信度说明

来源为 Scientific Data 同行评议数据论文，样本基因型、时间点、质控设计和 ENA 项目号均可在出版社摘要核验。它提供可复用的原始资源而非疗效或机制证明；单一苏格兰田间试验、ITS2 方法和两类组学不等量采样限制泛化，后续使用者仍需检查元数据、批次和许可条件。

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