中科院上海有机所发布 Void-X，蛋白质界面设计从整体骨架转向原子互作生成

学术圈重大事件 · 发布 2026-06-16T11:40:54+08:00 · 更新 2026-06-16T11:48:36+08:00

核心结论

中科院 6 月 16 日披露上海有机所 Void-X 模型，使用原子空位填充思路预测蛋白质内和蛋白质间相互作用，为蛋白质界面与药物互作设计提供更细粒度的生成式 AI 路线。

据中国科学院 6 月 16 日发布，上海有机化学研究所团队开发原子互作生成模型 Void-X，相关论文发表于 PNAS。该模型不是先生成完整蛋白质骨架再优化序列，而是针对特定结构区域生成与之匹配的原子分布，用“自下而上”的方式补足蛋白质界面中的相互作用空位。

公开页面给出的关键细节包括：团队从蛋白质数据库筛选构建超过 800 万个球形原子簇，以约 30% 外围连续原子作为待生成对象，其余原子作为上下文；Void-X 约 1.7 亿参数，在蛋白质链内原子簇预测任务中准确率为 78.3%，链间原子簇预测为 68.2%。

这项工作的意义在于把蛋白质设计从“形状能否贴合”推进到“原子互作是否合理”。对抗体、胞内蛋白递送和难成药靶点设计来说，局部界面能否被物理可解释地生成，可能比单纯扩大结构生成规模更接近药物发现工作流。仍需观察的是，该模型在真实结合亲和力、细胞内稳定性和实验闭环优化中的表现。

信息来源

• 中国科学院
• PNAS

可信度说明

主要依据为中科院官网与 PNAS DOI 页面，属于机构发布加同行评议论文信息，可信度较高。中科院页面披露了模型规模、训练数据构造和预测准确率，但实际药物研发价值仍需看独立实验验证、开放实现情况和下游蛋白设计成功率。

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