SSRHunter
分类：生物信息 & 生命科学 · 标签：生物信息 / 群体遗传 / 基因组学 / 分子标记 / 植物育种 / SSR / 微卫星
批量查找 SSR 微卫星位点
SSRHunter 是一款本地运行的微卫星（SSR, Simple Sequence Repeats）位点查找软件，用于在 FASTA 格式的 DNA/RNA 序列中批量扫描二至六核苷酸等重复类型，并输出位点位置、重复单元（motif）、重复次数及上下游序列。它支持序列自动预处理、整理、转换与结果报表导出，常用于 SSR 标记开发流程——位点挖掘→引物设计（如 Primer3）→PCR 验证→群体分型。软件由南京农业大学 Qiang Li 与 Jian-Min Wan 开发（2005 年发表于《遗传》），面向分子育种、群体遗传与基因组/转录组资源整理的研究人员。