GeneDoc
分类:生物信息 & 生命科学 · 标签:序列注释 / 生信入门 / 蛋白结构 / 进化遗传 / 分子系统 / 多序列比对 / MSA
多序列比对查看编辑与着色
GeneDoc 是一款经典的多重序列比对(MSA)查看与编辑工具,主打对齐结果可视化、手动微调、按保守性/相似性着色高亮,以及导出可发表的比对图。它更偏向比对结果的查看、精修与出图:通常先用 ClustalW/Clustal Omega/MUSCLE 等生成对齐,再导入 GeneDoc 做着色、注释与展示。软件同时适用于 DNA 与蛋白序列,尤以蛋白比对的保守性着色和基序检查最为常用。由 Karl B. Nicholas、Hugh B. Nicholas Jr. 与 David W. Deerfield 开发,源码以 GPL 协议在 GitHub 开放。