Diamond
分类:生物信息 & 生命科学 · 标签:高通筛选 / 基因注释 / 功能预测 / 蛋白比对 / 宏基注释 / BLAST / 序列比对 / 宏基因组
高速蛋白序列相似性比对
DIAMOND(Diamond 3.2i)是一款面向生命科学的高速序列比对工具,用于将蛋白序列或由核酸翻译得到的蛋白与大型参考数据库(NR/UniProt/自建库)进行相似性搜索,对应 BLASTP / BLASTX 比对模式。它在很多任务上替代或加速传统 BLAST 流程,速度可达 BLAST 的 100x–10000x,典型敏感度为 BLAST 的 90%–99%。常用于宏基因组高通量检索、基因组同源注释与多样本批处理流水线,输出 BLAST pairwise、tabular(outfmt 6)、XML 等格式,并支持蛋白聚类与分类学注释。