Data Resource Profile: Nationwide registry data for high-throughput epidemiology and machine learning (FinRegistry)

作者：Essi Viippola, Sara Kuitunen, Rodosthenis S. Rodosthenous, Andrius Vabalas, Tuomo Hartonen, Pekka Vartiainen, Joanne Demmler, Anna‐Leena Vuorinen, Aoxing Liu, Aki S. Havulinna, Vincent Llorens, Kira E. Detrois, Feiyi Wang, Matteo Ferro, Antti Karvanen, Jakob German, Sakari Jukarainen, Javier Gracia‐Tabuenca, Tero Hiekkalinna, Sami Koskelainen, Tuomo Kiiskinen, Elisa Lahtela, Susanna Lemmelä, Teemu Paajanen, Harri Siirtola, Mary Pat Reeve, Kati Kristiansson, Minna Brunfeldt, Mervi Aavikko, Finn Gen, Markus Perola, Andrea Ganna, FinnGen, Aarno Palotie, Mark Daly, Bridget Riley-Gills, Howard J. Jacob, Dirk S. Paul, Athena Matakidou, Adam Platt, Heiko Runz, Sally John, George Okafo, Nathan Lawless, Heli Salminen‐Mankonen, Robert M. Plenge, Joseph Maranville, Mark I. McCarthy, Margaret G Ehm, Kirsi Auro, Simonne Longerich, Caroline S. Fox, Anders Mälarstig, K. Klinger, Clément Chatelain, Matthias Gossel, Karol Estrada, Robert Graham, Robert Yang, Chris O’Donnell, Tomi P. Mäkelä, Jaakko Kaprio, Petri Virolainen, Antti Hakanen, Terhi Kilpi, Jukka Partanen, Anne Pitkäranta, Taneli Raivio, Raisa Serpi, Tarja Laitinen, Veli-Matti Kosma, Jari A. Laukkanen, Marco Hautalahti, Outi Tuovila, Raimo Pakkanen, Jeffrey Waring, Bridget Riley-Gillis, Fedik Rahimov, Ioanna Tachmazidou, Chia-Yen Chen, Heiko Runz, Zhihao Ding, Marc Jung, Shameek Biswas, Rion Pendergrass, Margaret G Ehm, David Pulford, Neha Raghavan, Adriana Huertas‐Vázquez, Jae-Hoon Sul, Anders Mälarstig, Xinli Hu, Åsa K. Hedman, K. Klinger, Robert Graham, Manuel A. Rivas, Dawn Waterworth, Nicole Renaud, Ma’en Obeidat, Samuli Ripatti, Johanna Schleutker, Markus Perola, Mikko Arvas, Olli Carpén, Reetta Hinttala, Johannes Kettunen, Arto Mannermaa, Katriina Aalto‐Setälä, Mika Kähönen, Jari Laukkanen, Johanna Mäkelä, Reetta Kälviäinen, Valtteri Julkunen, Hilkka Soininen, Anne M. Remes, Mikko Hiltunen, Jukka Peltola, Minna Raivio, Pentti Tienari, Juha O. Rinne, Roosa Kallionpää, Juulia Partanen, Ali Abbasi, Adam Ziemann, Nizar Smaoui, Anne Lehtonen, Susan Eaton, Heiko Runz, Sanni Lahdenperä, Shameek Biswas, Natalie Bowers, Edmond Teng, Rion Pendergrass, Fanli Xu, David Pulford, Kirsi Auro, Laura Addis, John D. Eicher, Qingqin S. Li, Karen He, Ekaterina Khramtsova, Neha Raghavan, Martti Färkkilâ, Jukka Koskela, Sampsa Pikkarainen, Airi Jussila, Katri Kaukinen, Timo Blomster, Mikko Kiviniemi, Markku Voutilainen, Mark Daly, Ali Abbasi, Jeffrey F. Waring, Nizar Smaoui, Fedik Rahimov, Anne Lehtonen, Tim Lu, Natalie Bowers, Rion Pendergrass, Linda McCarthy, Amy Hart, Meijian Guan, Jason Miller, Kirsi Kalpala, Melissa Miller, Xinli Hu, Kari K. Eklund, Antti Palomäki, Pia Isomäki, Laura Pirilä, Oili Kaipiainen‐Seppänen, Johanna Huhtakangas, Nina Mars, Ali Abbasi, Jeffrey Waring, Fedik Rahimov, Apinya Lertratanakul, Nizar Smaoui, Anne Lehtonen, Marla Hochfeld, Natalie Bowers, Rion Pendergrass, Jorge Esparza Gordillo, Kirsi Auro, Dawn Waterworth, Fabiana Farias, Kirsi Kalpala, Nan Bing, Xinli Hu, Tarja Laitinen, Margit Pelkonen, Paula Kauppi, Hannu Kankaanranta, Terttu Harju, Riitta Lahesmaa, Nizar Smaoui, Glenda Lassi, Susan Eaton, Hubert Chen, Rion Pendergrass, Natalie Bowers, Joanna Betts, Kirsi Auro, Rajashree Mishra, Majd Mouded, Debby Ngo, Teemu Niiranen, Felix Vaura, Veikko Salomaa, Kaj Metsärinne, Jenni Aittokallio, Mika Kähönen, Jussi Hernesniemi, Daniel Gordin, Juha Sinisalo, Marja‐Riitta Taskinen, Tiinamaija Tuomi, Timo P. Hiltunen, Jari Laukkanen, Amanda Elliott, Mary Pat Reeve, Sanni Ruotsalainen, Benjamin Challis, Dirk S. Paul, Natalie Bowers, Rion Pendergrass, Audrey Y. Chu, Kirsi Auro, Dermot F. Reilly, Mike Mendelson, Jaakko Parkkinen, Melissa Miller, Tuomo J Meretoja, Heikki Joensuu, Olli Carpén, Johanna Mattson, Eveliina Salminen, Annika Auranen, Peeter Karihtala, Päivi Auvinen, Klaus Elenius, Johanna Schleutker, Esa Pitkänen, Nina Mars, Mark Daly, Relja Popovic, Jeffrey F. Waring, Bridget Riley-Gillis, Anne Lehtonen, Jennifer L. Schutzman, Natalie Bowers, Rion Pendergrass, Diptee Kulkarni, Kirsi Auro, Alessandro Porello, Andrey Loboda, Heli Lehtonen, Stefan McDonough, Sauli Vuoti, Kai Kaarniranta, Joni A. Turunen, Terhi Ollila, Hannu Uusitalo, Juha Karjalainen, Esa Pitkänen, Mengzhen Liu, Heiko Runz, Stephanie Loomis, Erich C. Strauss, Natalie Bowers, Hao Chen, Rion Pendergrass, Kaisa Tasanen, Laura Huilaja, Katariina Hannula‐Jouppi, Teea Salmi, Sirkku Peltonen, Leena Koulu, Nizar Smaoui, Fedik Rahimov, Anne Lehtonen, David F. Choy, Rion Pendergrass, Dawn Waterworth, Kirsi Kalpala, Ying Wu, Pirkko J. Pussinen, Aino Salminen, Tuula Salo, David Rice, Pekka Nieminen, Ulla Palotie, Maria Siponen, Liisa Suominen, Päivi Mäntylä, Ulvi Kahraman Gürsoy, Vuokko Anttonen, Kirsi Sipilä, Rion Pendergrass, Hannele Laivuori, Venla Kurra, Laura Kotaniemi‐Talonen, Oskari Heikinheimo, Ilkka Kalliala, Lauri A. Aaltonen, Varpu Jokimaa, Johannes Kettunen, Marja Vääräsmäki, Outi Uimari, Laure Morin‐Papunen, Maarit Niinimäki, Terhi Piltonen, Katja Kivinen, Elisabeth Widén, Taru Tukiainen, Mary Pat Reeve, Mark Daly, Niko Välimäki, Eija Laakkonen, Jaakko Tyrmi, Heidi Silven, Eeva Sliz, Riikka K. Arffman, Susanna Savukoski, Triin Laisk, Natalia Pujol, Mengzhen Liu, Bridget Riley-Gillis, Rion Pendergrass, Janet Kumar, Kirsi Auro, Iiris Hovatta, Chia-Yen Chen, Erkki Isometsä, Hanna M. Ollila, Jaana Suvisaari, Thomas D. Als, Antti Mäkitie, Argyro Bizaki-Vallaskangas, Sanna Toppila‐Salmi, Tytti Willberg, Elmo Saarentaus, Antti A. Aarnisalo, Eveliina Salminen, Elisa Rahikkala, Johannes Kettunen, Kristiina Aittomäki, Fredrik Åberg, Mitja Kurki, Samuli Ripatti, Mark Daly, Juha Karjalainen, Aki S. Havulinna, Juha Mehtonen, Priit Palta, Shabbeer Hassan, Pietro Della Briotta Parolo, Wei Zhou, Mutaamba Maasha, Shabbeer Hassan, Susanna Lemmelä, Aarno Palotie, Aoxing Liu, Arto Lehistö, Andrea Ganna, Vincent Llorens, Hannele Laivuori, Taru Tukiainen, Mary Pat Reeve, Henrike Heyne, Nina Mars, Joel Rämö, Elmo Saarentaus, Hanna M. Ollila, Rodos Rodosthenous, Satu Strausz, Tuula Palotie, Kimmo Palin, Javier Gracia‐Tabuenca, Harri Siirtola, Tuomo Kiiskinen, Jiwoo Lee, Kristin Tsuo, Amanda Elliott, Kati Kristiansson, Mikko Arvas, Kati Hyvärinen, Jarmo Ritari, Olli Carpén, Johannes Kettunen, Katri Pylkäs, Eeva Sliz, Minna K. Karjalainen, Tuomo Mantere, Eeva Kangasniemi, Sami Heikkinen, Arto Mannermaa, Eija Laakkonen, Nina Pitkänen, Samuel Lessard, Clément Chatelain, Perttu Terho, Tiina Wahlfors, Jukka Partanen, Eero Punkka, Raisa Serpi, Sanna Siltanen, Veli-Matti Kosma, Teijo Kuopio, Anu Jalanko, Huei-Yi Shen, Risto Kajanne, Mervi Aavikko, Henna Palin, Malla-Maria Linna, Mitja Kurki, Juha Karjalainen, Pietro Della Briotta Parolo, Arto Lehistö, Juha Mehtonen, Wei Zhou, Masahiro Kanai, Mutaamba Maasha, Zhili Zheng, Hannele Laivuori, Aki S. Havulinna, Susanna Lemmelä, Tuomo Kiiskinen, L. Elisa Lahtela, Mari Kaunisto, Elina Kilpeläinen, Timo P. Sipilä, Oluwaseun Alexander Dada, Awaisa Ghazal, Anastasia Kytölä, Rigbe Weldatsadik, Sanni Ruotsalainen, Kati Donner, Timo P. Sipilä, Anu Loukola, Päivi Laiho, Tuuli Sistonen, Essi Kaiharju, Markku Laukkanen, Elina Järvensivu, Sini Lähteenmäki, Lotta Männikkö, Regis Wong, Auli Toivola, Minna Brunfeldt, Hannele Mattsson, Kati Kristiansson, Susanna Lemmelä, Sami Koskelainen, Tero Hiekkalinna, Teemu Paajanen, Priit Palta, Kalle Pärn, Mart Kals, Shuang Luo, Tarja Laitinen, Mary Pat Reeve, Shanmukha Sampath Padmanabhuni, Marianna Niemi, Harri Siirtola, Javier Gracia‐Tabuenca, Mika Helminen, Tiina Luukkaala, Iida Vähätalo, Jyrki Tammerluoto, Marco Hautalahti, Johanna Mäkelä, Sarah Smith, Tom Southerington, Petri Lehto, Markus Perola · 发表于：International Journal of Epidemiology · 年份：2023 · DOI：10.1093/ije/dyad091 · 被引用次数：28 · 研究领域：Health, Environment, Cognitive Aging、Machine Learning in Healthcare、Chronic Disease Management Strategies

FinRegistry is a curated, nationwide, register-based data resource for developing statistical and machine learning models, performing high-throughput epidemiological analyses and deriving outcome-specific prediction models. FinRegistry data are collected across 19 registries covering public health care visits, health conditions, medications, vaccinations, laboratory responses, demographics, familial relations and socioeconomic variables, with decades of follow-up for most registries. FinRegistry includes everyone living in Finland on 1 January 2010, as well as their parents, spouses, children and siblings, comprising a sample size of approximately 7.2 million persons. FinRegistry data are mapped to more than 3000 clinical endpoints defined by leveraging multiple registers and clinical expertise as part of the FinnGen project. The Risteys web portal [https://risteys.finregistry.fi] enables exploration of clinical endpoint definitions, their links to international ontologies and the results of epidemiological analyses to gain insights into disease epidemiology in the Finnish population. Access to FinRegistry is granted via the Finnish Social and Health Data Permit Authority Findata, which provides a clear and transparent application process and delivers the pseudonymized data in a secure computing environment. Nationwide health-related registry data provide comprehensive insights into population health and, combined with other data such as demographics, familial relations and s...