Validation fonctionnelle du rôle des miARNs dans la tolérance au phénanthrène chez Spartina : Utilisation d’Arabidopsis en système hétérologue

作者：Loup Tran Van Canh · 年份：2018 · 研究领域：Plant Stress Responses and Tolerance、Plant Molecular Biology Research、Plant Gene Expression Analysis

L’etude des mecanismes de tolerance des plantes aux polluants environnementaux represente aujourd’hui un axe de recherche majeur dans une perspective de depollution environnementale. Le projet de stage repose sur l’analyse de miARNs recemment annotes chez Spartina (Poaceae, Chloridoideae) et differentiellement exprimes en condition de stress par les HAPs selon des donnees small-RNAseq. Afin de valider la fonction des familles de miARNs differentiellement exprimes chez Spartina, l’effet de la mutation de leurs homologues chez Arabidopsis a ete etudie. La validation des donnees de sequencage a ete realisee en RT-qPCR et un ensemble de genes MIR candidats ont ete selectionnes afin d’identifier des lignees mutantes chez Arabidopsis. Une banque de graines mutantes T-DNA homozygotes correspondant a 31 lignees (mutants knock-out ou knock-down) de genes MIR et cibles d’interets a ete constituee. Un criblage phenotypique de l’effet du phenanthrene sur le developpement de leur racine primaire a permis de mettre en evidence des phenotypes d’hypersensibilite et de tolerance associees respectivement aux MIR156 et MIR159. Les resultats d’une approche inverse par des traitements miPEP qui induisent specifiquement la surexpression des genes MIR sauvage semblent confirmer ces observations.